| 一种基于纳米孔过孔电流估计蛋白质构象形貌特征的方法 | |
张明焜 ; 龙勉; 吕守芹
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| 2022-09-16 | |
| Rights Holder | 中国科学院力学研究所 |
| Abstract | 本发明公开了一种基于纳米孔过孔电流估计蛋白质构象形貌特征的方法，所述方法为：基于纳米孔特征电流，通过一个或多个类球体，对蛋白质的构象进行形貌估计；其中，对于类球形蛋白质，采用一个类球体进行形貌特征的估计，通过解析相对阻塞电流和取向角的关系，获得类球体的轴长；对于非类球形蛋白，采用多个类球体的连体进行形貌的估计，通过解析相对阻塞电流和取向角、各类球体之间角度的关系，获得了每个类球体的轴长。该方法解决了现有技术中过孔电流难以反映蛋白质构象形貌特征的问题。 |
| Application Date | 2021-08-16 |
| Application Number | CN202110936068.0 |
| Patent Number | CN113686235B |
| Claim | 1.一种基于纳米孔过孔电流估计蛋白质构象形貌特征的方法，其特征在于，所述方法为：基于纳米孔特征电流，通过一个或多个类球体，对蛋白质的构象进行形貌估计；其中，对于类球形蛋白质，采用一个类球体进行形貌特征的估计，通过解析相对阻塞电流和取向角的关系，获得类球体的轴长；对于非类球形蛋白，采用多个类球体的连体进行形貌的估计，通过解析相对阻塞电流和取向角、各类球体之间角度的关系，获得每个类球体的轴长； 所述方法具体包括： 1)获得蛋白质晶体三维空间结构在纳米孔径向上的投影面积或外接圆的直径最大和最小的方向作为2个特殊取向； 2)获得所述蛋白质晶体三维空间结构在纳米孔径向上的多个任意取向，并基于所述2个特殊取向计算任意取向的取向角； 3)选取与所述蛋白质晶体三维空间结构的尺寸相匹配的纳米孔，获得仅充满电解质溶液的纳米孔的过孔电流I0以及孔内阻塞有不同取向的所述蛋白质晶体三维空间结构时的过孔电流I，获得不同取向下所述蛋白质晶体三维空间结构对纳米孔的相对阻塞电流ΔI/I0，其中，ΔI＝I0-I； 4)对于类球形蛋白质，基于一个类球状体解析相对阻塞电流随取向角单一变量的变化规律，获得一个类球体的特征尺寸； 对于非类球形蛋白，基于多个类球状体解析相对阻塞电流随取向角、多个类球体之间夹角的双变量的变化规律，获得各类球体的特征尺寸； 5)基于最优拟合原则，确定各类球体的形状； 6)获得蛋白质的形貌特征。 |
| Language | 中文 |
| Classification | 发明授权 |
| Status | 有效 |
| Note | 授权 |
| Country | 中国 |
| Agency | 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) |
| Document Type | 专利 |
| Identifier | http://dspace.imech.ac.cn/handle/311007/91131 |
| Collection | 微重力重点实验室 |
| Recommended Citation GB/T 7714 | 张明焜,龙勉,吕守芹. 一种基于纳米孔过孔电流估计蛋白质构象形貌特征的方法. CN113686235B[P]. 2022-09-16. |
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| 000000_20220916_0C_C（612KB） | 专利 | 开放获取 | CC BY-NC-SA | View Download | ||
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